Το Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (ΠΜΣ) «Νευροαποκατάσταση» του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας ιδρύθηκε το 2019 (ΦΕΚ 277/2019, τ. Β΄) από τη Νευρολογική Κλινική του Πανεπιστημίου και αναμορφώθηκε το 2024 (ΦΕΚ 4028/2024, τ. Β΄), υλοποιούμενο με εξ αποστάσεως εκπαιδευτική διαδικασία. Το πρόγραμμα δέχεται περίπου 60 φοιτητές ετησίως. Μέχρι σήμερα έχουν απονεμηθεί περισσότερα από 200 Διπλώματα Μεταπτυχιακών Σπουδών.
Το ΠΜΣ «Νευροαποκατάσταση» του Πανεπιστημίου Θεσσαλίας διακρίνεται για τον διεπιστημονικό του χαρακτήρα, αξιοποιώντας τη συνεργασία με ακαδημαϊκούς φορείς όπως το Πανεπιστήμιο Θεσσαλίας (Τμήμα Ιατρικής, ΤΕΦΑΑ, Τμήμα Φυσικοθεραπείας, Τμήμα Ειδικής Αγωγής, Τμήμα Πληροφορικής και Τηλεπικοινωνιών),το ΕΚΠΑ(Τμήμα Ψυχολογίας) το Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης (Τμήμα Ψυχολογίας), το Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων (Τμήμα Λογοθεραπείας),Πανεπιστήμιο Πελοποννήσου (Τμήμα Λογοθεραπείας), Πανεπιστήμιο Κύπρου (Τμήμα Εργοθεραπείας) ενώ παράλληλα επαγγελματίες υγείας στον τομέα της αποκατάστασης διδάσκουν θεωρητικά και καθοδηγούν πρακτικά, ενισχύοντας ουσιαστικά την εκπαιδευτική διαδικασία.